Cieto riekstu vācelīte

Prezentācija par tēmu: "Cieto riekstu vācelīte"— Prezentācijas transkripts:

1 Cieto riekstu vācelīte
Jānis Liepiņš 11/12/2004

2 1 nm a) 10-3 m 2 mm b) 103 m 3 cm c) 10-6 m 4 km d) 10-12 m e) 10-2 m
Sakārtojiet kreisās kolonnas lielumus ar tiem atbilstošajām otrās kolonnas vērtībām 1 nm a) 10-3 m 2 mm b) 103 m 3 cm c) 10-6 m 4 km d) m e) 10-2 m 5 mm f) 10-9 m 6 pm

3 OD (Optical Density) ir lielums, kas
2 OD (Optical Density) ir lielums, kas raksturo dotā šķīduma "caurspīdīgumu", pēc kā savukārt var spriest par tajā suspendēto vielu/daļiņu koncentrāciju. OD600 izmanto šūnu kultūras blīvuma mērīšanai. OD600 atkarība no šūnu skaita ml ir lineāra (grafiks taisne); OD600= 0 atbilst izejas šķīdumam bez šūnām, OD600=1 šūnu skaits/ml =106/ml

4 Cik šūnu ir 100 ml šūnu suspensijas, ja nomērītais OD600= 0,21 ?
OD (Optical Density) ir lielums, kas raksturo dotā šķīduma "caurspīdīgumu", pēc kā savukārt var spriest par tajā suspendēto vielu/daļiņu koncentrāciju. OD600 izmanto šūnu kultūras blīvuma mērīšanai. OD600 atkarība no šūnu skaita ml ir lineāra (grafiks taisne); OD600= 0 atbilst izejas šķīdumam bez šūnām, OD600=1 šūnu skaits/ml =106/ml Cik šūnu ir 100 ml šūnu suspensijas, ja nomērītais OD600= 0,21 ?

5 Lai uzsētu biezu (liels OD600) suspensiju uz
3 Lai uzsētu biezu (liels OD600) suspensiju uz barotnēm un varētu atlasīt atsevišķas šūnas lieto atšķaidījumu metodi. Atšķaida izejas kultūru 10 reižu, to vēlreiz 10x, to atkal utt.... Tādā veidā iegūtos atšķaidījumus sauc par pirmo, otro, 3-o...utt atšķaidījumiem.

6 Pieņem, ka viena kolonija veidojas no vienas šūnas.
3 Lai uzsētu biezu (liels OD600) suspensiju uz barotnēm un varētu atlasīt atsevišķas šūnas lieto atšķaidījumu metodi. Atšķaida izejas kultūru 10 reižu, to vēlreiz 10x, to atkal utt.... Tādā veidā iegūtos atšķaidījumus sauc par pirmo, otro, 3-o...utt atšķaidījumiem. Cik kolonijas iegūst uz plates (teorētiski jāizaug) no 100 ml 5-tā atšķaidījuma (izejas kultūras OD600=5). Pieņem, ka viena kolonija veidojas no vienas šūnas.

7 Izdzīvotība ir lielums, kas raksturo
4 Izdzīvotība ir lielums, kas raksturo dzīvo indivīdu īpatsvaru populācijā, apzīmē SR (Survival Rate), aprēķina SR=nlive/nS, kur nlive – dzīvo īpatņu skaits, nS – kopējais īpatņu skaits Parasti SR izsaka procentos

8 Uzsējot 100 ml šūnu kultūras ar OD600=4,
Izdzīvotība ir lielums, kas raksturo dzīvo indivīdu īpatsvaru populācijā, apzīmē SR (Survival Rate), aprēķina SR=nlive/nS, kur nlive – dzīvo īpatņu skaits, nS – kopējais īpatņu skaits Uzsējot 100 ml šūnu kultūras ar OD600=4, 4-o atšķaidījumu, izauga 30 kolonijas. Kāda ir šūnu kultūras izdzīvotība? Pieņem, ka viena kolonija veidojas no vienas dzīvās šūnas.

9 Kādā palielinājumā redzami dotie objekti? A B Kas ir apzīmēts
5 5 cm Kādā palielinājumā redzami dotie objekti? A B Kas ir apzīmēts ar A un B?

10 Homoloģija (H) ir lielums, kas raksturo
6 Homoloģija (H) ir lielums, kas raksturo cik līdzīgas ir dotās DNS, RNS, proteīnu u.c sekvences. Sekvenču homoloģija ir relatīvs lielums, parasti to izsaka % Aprēķina: H = nsim/nS, kur nsim = vienādo atbilstošo elementu skaits (elementi atrodas vienādās pozīcijās) nS = kopējais fragmenta garums (elementu skaits virknē)

11 tgagtcctttgggattgtccactcctgatg cgagtcctttgggactgtcctctgcaaatg
6 Aprēķina: H = nsim/nS, kur nsim = vienādo atbilstošo elementu skaits (elementi atrodas vienādās pozīcijās) nS = kopējais fragmenta garums (elementu skaits virknē) Kāda ir doto DNS sekvenču homoloģija: Seq1 tgagtcctttgggattgtccactcctgatg Seq2 cgagtcctttgggactgtcctctgcaaatg

12 Drīz sekos atbildes!