Enzimoloģija/Metabolisms

Prezentācija par tēmu: "Enzimoloģija/Metabolisms"— Prezentācijas transkripts:

1 Enzimoloģija/Metabolisms
Transferāzes. To klasifikācija. Pārmetilēšanās procesi. Liāzes. Adenilāt ciklāze.Izomerāzes. Galaktozes metabolisms. Sintetāzes. Molekulāras bioloģijas (bioķīmijas)katedra 2008/2009. akad.gads

2

3

4

5 Pārmetilēšanās procesi

6

7

8 kobalamīns kobalamīns Sukcinīl-KoA Metīlmalonīlmutāze

9 Metionīn sintāze (KF.2.1.1.13) darbojas pēc ping-pong mehānisma

10

11 Kobamīd enzīmu katalizētās reakcijas:
Metīlmalonīlmutāze (metīlgrupu pārneses) Metionīn sintāze Leicīn aminomutāze Kobamīdenzīma katalizētā ribonukleotīdreduktāze

12 Vitamīns B12 vai kobalamīns, oksi, metīl, ciano- kobalamīni
Vitamīns B12 vai kobalamīns, oksi, metīl, ciano- kobalamīni. Kobalta atoms saistīts slāpekļa makrocikla korrīna reducētu tetrapirolu sistēmā: I un IV pirola gredzeni savienoti bez metīna tiltiņa I IV

13

14 IUBMB Enzyme Nomenclature
EC Accepted name: leucine 2,3-aminomutase Reaction: (2S)-α-leucine = (3R)-β-leucine Systematic name: (2S)-α-leucine 2,3-aminomutase Comments: Requires a cobamide coenzyme. Links to other databases: BRENDA, EXPASY, KEGG, ERGO, CAS registry number: References: 1. Freer, I., Pedrocchi-Fantoni, G., Picken, D.J. and Overton, K.H. Stereochemistry of the leucine 2,3-aminomutase from tissue-cultures of Andrographis paniculata. J. Chem. Soc. Chem. Commun. (1981) 2. Poston, J.M. Leucine 2,3-aminomutase, an enzyme of leucine catabolism. J. Biol. Chem. 251 (1976) [PMID: ] 3. Poston, J.M. Coenzyme B12-dependent enzymes in potatoes: leucine 2,3- aminomutase and methylmalonyl-CoA mutase. Phytochemistry 17 (1976)

15

16 Ribonukleotīdu pārveidošana dezoksiribonuleotīdos
CDP,ADP,GDP NADH FAD SH S-S SH UDP Tioredoksīn Tioredoksīns Ribonuleotīd- reduktāze B reduktāze, Se (KF ) NAD FADH S-S SH S-S dUDP

17 Pārskats par vienoglekļa savieojumu veidošanos, izlietošanu,
holīna cikls, betaīni, tetrahidrogēnfolskābes nozīme

18 Metilēto savienojumu funkcijas var būt visdažādākās
Anserine (beta-alanyl-N-methylhistidine) is a dipeptide. Found in the skeletal muscle and brain of mammals, it is an antioxidant and helps reduce fatigue. The pKa of the imidazole ring of histidine, when contained in anserine, is 7.04, making it an effective buffer at physiologic pH. Trigonelline is an alkaloid with chemical formula C7H7NO2. It is an inner salt formed by the addition of a methyl group to the nitrogen atom of nicotinic acid. Trigonelline is a product of the metabolism of niacin (vitamin B3) which is excreted in the urine.[1] Trigonelline is also found in coffee, where it may help to prevent dental caries by preventing the bacteria Streptococcus mutans from adhering to teeth.

19 Melatonīns veidojas vairāk tumsā un nospiež
seksuālhormonu sintēzi

20

21

22

23 Adenilātciklāzes telpiskā uzbūve

24

25 Heptahelikālā - heterotrimērā receptora darbība:
1. Ligands saistās ar heptahelikālo receptoru, 2. Receptors saists trimēro proteīnu, 3. Saistītā G proteīna  subvienība GDF vietā saista GTF, 4. GTP un G proteīna saistība isauc trimēra disociāciju, 5. GTF- subvienība aktivē adenilātciklāzi, 6. -subvienība hidrolizē GTF, 7. Veidojas GDF un G-proteīna trimērs.

26

27 Tālākās signāla transdukcijas piemērs pēc
cikliskā AMF izveidošanās

28

29

30 Citu cukuru ieslēgšanās metabolismā II
glikoze Laktoze beta-galaktozidāze galaktoze galaktozes -1-P UDF glikoze UTF Galaktozīl-1-fosfāt UDF- galaktozīl-pirofosforilāze uridīltransferāze (Galaktozēmija) glikozes-1-P P-P UDF - galaktoze UDF-glukozoepimerāze 1) Glikoproteīni 2) Glikolipīdi 3) Konjugācijai UDF-glikoze

31

32

33 3’-ACC...

34